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两所学校都不错，各有优势：
1、学校的办学层级对比：蚌埠医学院的办学层级：蚌埠医学院是安徽省属普通高等医学院校，皖南医学院的办学层级：皖南医学院是安徽省属普通高等医学院校。分析比较：两所学校的办学层级一样。
2、学校的地理位置对比：蚌埠医学院的地理位置：蚌埠医学院坐落在安徽省蚌埠市。皖南医学院的地理位置：皖南医学院坐落在安徽省芜湖市。分析比较：蚌埠和芜湖都是安徽省地级市、三线城市。两所学校的地理位置不相上下。
3、学校的占地面积对比：蚌埠医学院的占地面积：1751亩，皖南医学院的占地面积：700亩。分析比较：蚌埠医学院的占地面积比皖南医学院多1051亩，是皖南医学院的2倍多。蚌埠医学院的占地面积更大。
4、学校的校区数量对比：蚌埠医学院有5个校区：龙子湖校区、治淮校区、宏业校区、淮上校区、高铁校区；皖南医学院有3个校区：银湖校区、滨江校区、赭麓校区。分析比较：蚌埠医学院的校区数量比皖南医学院多2个。
5、学校的创办时间对比：蚌埠医学院的创办时间：1958年，由原上海第二医学院分迁和安徽医学院援建而成，至今已有65年的办学历史。皖南医学院的创办时间：1958年，前身为芜湖医学专科学校，至今已有65年的办学历史。分析比较：两所学校的创办时间为同一年。
6、学校的发展历程对比：蚌埠医学院获批为硕士、博士学位授予单位的时间：1981年，学校成为全国首批硕士学位授予单位，目前未取得博士学位授予权。皖南医学院获批为硕士、博士学位授予单位的时间：1981年，学校成为全国首批硕士学位授予单位，2019年，获批安徽省博士学位授权立项建设单位，目前未取得博士学位授予权。分析比较：两所学校获批为硕士学位授予单位的时间为同一年，目前均未取得博士学位授予权。
7、、学校的师资力量对比：蚌埠医学院的师资力量：学校现有教职工6000余人（含直属附属医院），其中省级以上人才137人。皖南医学院的师资力量：学校现有教职工5720人（含直属附属医院），其中省级以上人才58人。分析比较：蚌埠医学院教职工中省级以上人才人数比皖南医学院多，师资力量强于皖南医学院。
8、学校的硬件设施对比：蚌埠医学院的硬件设施：图书馆：总藏书114.6万册。学校拥有27个省级以上科研平台。学校拥有2家直属附属医院。皖南医学院的硬件设施：图书馆：总藏书427万册。学校拥有13个省级以上科研平台。学校拥有2家直属附属医院。分析比较：蚌埠医学院的图书馆总藏书量比皖南医学院少，但省级以上科研平台数量比皖南医学院多14个。综合分析，蚌埠医学院的教学硬件设施好于皖南医学院。
9、学校的经费预算对比：蚌埠医学院2023年经费预算：6.38亿元。皖南医学院2023年经费预算：6.96亿元分析比较：皖南医学院2023年经费预算比蚌埠医学院多0.58亿元。国家及地方对皖南医学院的资金投入更大。
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