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第一,资金来源不同。履约保证金一般来自承包方的流动资金,在施工前付给发包方。质量保证金是发包方与承包方在建设工程承包合同中约定或承包方在工程保修书中承诺,在工程竣工验收交付使用后,从应付的建设工程款中预留的用以维修工程在保修期限和保修范围内出现的质量缺陷的资金。第二,约束的目的不同。履约保证金的目的是担保承包人完全履行合同,主要保证工期和质量符合合同的约定。履约保证金的功能,在于承包人违约时,赔偿发包人的损失,也即如果承包人违约,将丧失收回履约保证金的权利,且,并不以此为限。质量保证金则更多的是一种约束工程质量的手段。第三,保证金的比例和返还时间不同。
支付履约保证金转账如何备注
1、履约保证金，是指施工单位为了全面履行合同条款中，所承的条件，在施工前，用自己的流动资金抵押在建设单位用，不计利息，待工程全部完工后该款元、、并且全部履行合同条款时，建设单位将此款推给施工单位，施工单位如果有违约行为，建设单位按事先拟定的数额扣除，余者返回施工单位；
2、质量保证金，施工单位已将工程全部完工，理应工程款全部结清，但是由于工程还没有经过使用，验收时只能从外表检查，工程的质量标准是否达到设计要求，还需要时间的验证，为此建设单位用应付工程款，按一定的比例暂留，待保修期满，为发生质量问题，全部付给施工单位；
3、两者区别，（1）、履约保证金是施工单位的流动资金，在施工前付给建设单位，用于施工过程中全面履行合同的制约办法；
（2）、质量保证金是施工单位工程完工后、用工程结算款抵押，也是约束工程质量的手段，两者的资金来源不同，约束的目的不同。
一、履约保证金（质保金）的收取流程如下：
（一）供货商依据合同通过银行转账并备注xx采购项目（合同编号）履约保证金（或质保金）。
（二）归口管理单位填写《外来经费确认表》（财务处网页下载）并附转账回执单到财务处入账、开具收据。
二、履约保证金（质保金）的退还流程如下：
（一）到合同约定的退还期限后，对符合退换条件的事项，请供应商持退款申请和公司开具给学校的退还履约保证金（质保金）的收据到归口管理单位（项目采购时支出经费所属的负责单位）办理。有不清楚归口管理单位的，可联系采购与招标管理中心查询。
（二）归口管理单位将收据粘贴在《财务票据粘贴单》并完善签字手续后，随退款申请一起交财务处办理。
退款申请参考格式如下：
退款申请：
我公司于20xx年与贵校签订了xxxx合同，并交纳了合同总金额5%的履约保证金（质保金），金额为人民币大写XXXX元（￥xxxx元），现合同约定的退还期限已到，我公司所供设备（或承建项目）运行正常，无质量问题，特申请退还履约保证金（质保金）。
履约保证金（质保金）请转入我公司账户，开户行XXXX，账号XXXX。
XXXX（公章）。
联系人：XXXX。
电话：XXXX。
XX年XX月XX日。
设备使用单位意见（公章）：
签字：
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